线粒体基因组 | 破解按蚊“大户人家”的谱系

夏天说来就来了，蚊子说有就有了。晚饭后遛了一趟小公园，腿上又红痒起来了~~~

啊！蚊子！

之前有跟大家分享过，蚊子和它的核基因组是有多“难搞”。

既然如此，我们还能对蚊子做些什么呢？

绝不只是拿出six god这么简单~~

被咬之后，问候蚊子它全家的心，相信我有，您也有~~ 蚊子这个“大户人家”，想从基因组上搞明白它的“家谱”也还是颇费一些功夫的。

线粒体基因组在结构和进化上严格遵循母体遗传规律，含有丰富的群体遗传学和系统发育研究信息。

今天就跟大家聊聊，蚊子的线粒体基因组~~

中华按蚊作为国内主要的病原体携带者，也是按蚊家族的重要成员，自然吸引了国内研究者的注意——2017年，中华按蚊的线粒体基因组发布（下图）：

研究得到了两个完整的中华按蚊线粒体基因组，全长分别为15，076bp和15，138bp.除了AT富集的控制区域外，这两个序列大部分为保守序列。从上图可以看出，中华按蚊An. sinensis的线粒体包含13个蛋白编码基因，22个tRNA，2个rRNA(12s rRNA和16s rRNA)及AT富集控制区。J链和N链没有明显的长度差异。

在按蚊的线粒体基因组中，13个没有内含子的蛋白质编码基因（Table 1），这些基因与双翅目蚊科的其他物种线粒体基因在数量，方向及转录方向上均保持一致。其中，9个基因（ND2, CO1, CO2,ATPase8, ATPase6, CO3, ND3, ND6 and CytB）位于J链，4个基因（ND1, ND5, ND4 and ND4L）位于N链。

22个tRNA基因的状况与其他蚊科物种也保持较高一致性（Table 2）:

线粒体基因组研究到这个时候，就要好好说说按蚊家族的事儿了~

选用冈比亚按蚊（An. gambiae）为参考基因组，28种已发表按蚊的线粒体基因组构建系统发育树，我们得到了按蚊家族的系统发育亲缘关系（下图）。从系统发育树不难看出，按蚊家族基于亲缘关系远近可以分为两个较大分支的四个亚属，分别是Kerteszia, Cellia，Anopheles和Nyssorhynchus.其中，后三个支系为单系， Cellia与Anopheles亲缘关系更近。

Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome in Anopheles sinensis (Diptera: Culicidae). Infectious Diseases of Poverty, 2017.