RNA-seq报告解读:可变剪切分析

可变剪切使一个基因产生多个mRNA转录本,不同 mRNA可能翻译成不同蛋白。因此,通过可变剪切一个基因可能产生多个蛋白,极大地增加了蛋白多样性。基于StringTie[9]软件对reads进行组装结果,我们可以检测样本中存在的可变剪切事件,采用软件为ASprofile[10]。


在生物体内,存在各种可变剪切类型:

生物体各种可变剪切类型

几种可变剪切示意图如下图所示:

可变剪切结果表头说明

各样本可变剪切事件统计图如下:

各样本不同剪切事件频数统计图

图片说明:横坐标表示频数,纵坐标表示不同的可变剪切事件。

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