启衡星哺乳动物/植物通用型rRNA去除试剂盒——助力circRNA的研究

环状RNA（circRNA）是一类单链、共价闭合的RNA分子。在从病毒到动植物中普遍存在。与传统的线性mRNA 不同，circRNA 分子中不存在 5' cap 和 3' poly-A 尾。相反，分子两端之间的反向连接形成了环状结构，使其不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。CircRNA 具有多种生物学功能，包括 充当转录调节因、microRNA 海绵、RNA 结合蛋白 (RBP) 海绵，通过与前 mRNA 剪接竞争的基因调控，以及外显子-内含子环状 RNA 的亲本基因调控。这些典型特征使其在疾病研究中的应用备受关注，特别是作为癌症诊断的潜在生物标志物。

CircRNA的形成

案例分享

案例分享一：赵方庆团队揭示circRNA促进相的分离调控肿瘤发展分子机制

赵方庆团队的研究报道了circRNA circVAMP3通过促进CAPRIN1蛋白相分离，在细胞内形成应激颗粒 （stress granules） 以阻止c-Myc mRNA的翻译，进而抑制肝细胞性肝癌 （HCC） 的发生发展。该工作首次证实了环状RNA可以通过发挥分子骨架的功能促进相分离形成，从而调控肿瘤的增殖与迁移过程，为恶性肿瘤的研究提供了新的分子标志物和治疗靶点。

首先，该团队通过对20对肝癌及癌旁样本的RNA-seq数据进行挖掘，筛选到了在肝癌中表达显著下调且其母本基因变化不大的环状RNA——circVAMP3。circVAMP3由VAMP3基因的第3、4外显子通过反向剪接成环，具有与线性VAMP3基因截然不同的表达模式，并且与患者的预后显著相关。研究人员利用RNA干扰技术，通过体内外功能实验证明了circVAMP3具有抑制HCC细胞增殖和迁移的作用 （图3） 。

图3. circVAMP3的分子特征以及对HCC的抑制作用。

其次，他们对circVAMP3调控肝癌发生的机制进行了深入探究。通过对circVAMP3互作分子的筛选发现，circVAMP3可以作为分子骨架与CAPRIN1蛋白的RGG结构域结合，进而招募CAPRIN1-G3BP1复合物，导致蛋白聚集并发生相分离，在细胞中促进应激颗粒的形成。尽管先前的研究表明线性RNA可调控蛋白相分离过程，该研究首次证实了环状RNA也可通过聚集蛋白促进相分离的发生 （图4） 。

图4. circVAMP3促进CAPRIN1蛋白相分离和细胞内应激颗粒形成

随后，研究人员进一步发现circVAMP3通过抑制c-MYC蛋白的翻译，进而抑制肝癌细胞的增殖和迁移。通过共定位研究揭示了circVAMP3通过应激颗粒抑制c-Myc翻译的分子机制 （图5）。非常有意思的是，除了在肝脏中，circVAMP3在其他组织中 （如脑、胃、结肠、脾脏、肺、甲状腺、肾脏等） 也可以广泛表达，并且其在对应的肿瘤组织中表达量均发生下调。研究人员进一步对不同组织不同肿瘤细胞系对circVAMP3进行干扰实验，发现均可以抑制肿瘤细胞的增殖和迁移，这提示circVAMP3广泛参与了不同类型的肿瘤发生发展的普适性调控，以及其可能成为肿瘤研究共性靶标分子的潜力。

图5. circVAMP3抑制c-Myc的翻译，并在其他癌症中发挥其抑癌功能。