三篇Nature重磅| Olink Explore里程碑研究开启大规模人群蛋白质组学新时代

Olink于10月5日宣布在著名科学杂志 Nature《自然》上发布了三篇文章,展示了Olink Explore平台在推动大规模人群蛋白质组学研究方面的强大能力。

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这三篇发表于Nature杂志的重量级研究均使用了由英国生物库药物蛋白质组学项目UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)产生的数据,其中13家国际生物制药公司通过访问英国生物库生成了新的蛋白质组学数据。研究人员利用Olink Explore平台,在超过54,000名英国生物库参与者样本中测量了约3,000蛋白标志物。并在此史无前例的大规模人群队列研究上结合基因组和蛋白质组分析,获得了大量关于基因对影响蛋白质表达表型结果的新信息。这些发现展示了蛋白质组学在阐明生物机制、发现可操作的新生物标志物以及加速药物开发工作方面的巨大价值。
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第一篇来自UKB-PPP联盟Benjamin B. Sun博士等人[1]的最新旗舰论文提供了首批详细数据总结,同时匹配下游基于GWAS的蛋白质组学分析、蛋白质定量性状位点(pQTL)映射、横断面疾病关联以及人口因素和生理功能的蛋白质组预测等数据。文中报道发现了14,000多个蛋白质表达水平相关的遗传关联,且其中81%为最新发现。该篇具有里程碑意义的论文中的新发现,清楚地表明了高通量蛋白质测量对于识别重要生物途径及其对健康影响的重要性。


UKB 首席科学家
Naomi Allen 教授
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这个重大研究为生物医学界提供了全新的研究途径,是对于如何通过跨部门合作带来远超其各自部分总和结果的一个典范。所有这些蛋白组学数据,连同英国生物库中50万名志愿者的现有基因组、生活方式和健康数据一起,将很快向全球真正的研究人员开放。我对研究人员利用这些数据,来识别可能改变我们对疾病发展方式的理解,以及发现潜在新型治疗途径感到兴奋。
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第二篇由Ryan S Dhindsa博士等人联合发表的论文[2],主要由来自国际制药公司阿斯利康联盟的成员撰写,文中使用了上述首篇旗舰论文中数据集,研究了罕见蛋白质编码变异与蛋白质表达之间的遗传关联。研究结果揭示了罕见变异在血浆蛋白质水平改变和生物结果中的重要作用,进一步凸显了大规模蛋白质组学研究对于实现此类发现的关键需求。


AstraZeneca联盟
Ryan S Dhindsa 博士
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文中我们重点介绍了蛋白质编码pQTL图谱如何应对药物发现和临床流程挑战的几个实例。我们预计该资源将为蛋白质调控网络及其抑制可能增加靶蛋白水平上游转录调控基因提供新见解,并为药物安全评估药物再定位提供新契机。

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第三篇由G. H. Eldjarn博士等人[3]撰写的文章中将冰岛大规模人群队列研究数据结果做了两种技术对比,包括Olink蛋白组学平台和另一种基于适配体的技术。尽管两种平台都识别了大量与蛋白水平相关的遗传关联,但基于Olink蛋白组学平台数据结果显示,其与顺式pQTL相关性具有显著更高比例72%(与基于适配体技术的43%相比),这为Olink平台具有更高特异性提供了强有力的遗传证明。此外,Olink平台数据的中位数变异系数(median CV ratio)更低,表明其平均值更精确


Olink 首席执行官
Jon Heimer
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Olink非常自豪地成为UKB-PPP倡议的蛋白质组学技术平台的独家选择,我们也很高兴看到来自该出色合作团队的首次发表成果。这些里程碑式的发表文章强有力地证明了下一代蛋白质组学如何揭示传统基因组学无法看到的关键生物学洞察。我们正在见证一个新的多组学时代,它将使我们对实时人类生物学的理解达到前所未有的高度,并推动21世纪医疗健康和药物开发的新征程。

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三篇Nature文献:
1. Sun et al. (2023) Plasma proteomic associations with genetics and health in the UK Biobank. Nature, DOI: 10.1038/s41586-023-06592-6
2. Dhindsa et al. (2023) Rare variant associations with plasma protein levels in the UK Biobank. Nature, DOI: 10.1038/s41586-023-06547-x
3. Eldjarnet al. (2023) Large-scale plasma proteomics comparisons through genetics and disease associations. Nature, DOI: 10.1038/s41586-023-06563-x


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