Summary GO Enrichment(统计GO富集结果)
分析模块,输入差异基因GO富集分析HTML结果文件(链接所有GO富集分析的结果),得到样品或分组间的富集检验p值分布表。
输入:
差异基因GO富集分析HTML文件(链接所有GO富集分析的结果),由分析模块“Batch Mode: GO Enrichment Analysis”生成。
示例:
输出:
样品或分组间的富集检验p值分布表。
示例:
T4_vs_T5 T4_vs_T6 T4_vs_T7 T4_vs_T8 T4_vs_T9 T5_vs_T6 T5_vs_T7 T5_vs_T8 T5_vs_T9 T6_vs_T7 T6_vs_T8 T6_vs_T9 T7_vs_T8 T7_vs_T9 T8_vs_T9
GO:0005575 cellular_component 1 1 0.00302 1 1 1 0.0453 0.0158 1 0.0234 1 1 0.00126 1 1
GO:0000990 transcription factor activity, core RNA polymerase binding 1 1 1 0.0392 1 1 1 0.00511 1 1 0.0063 1 1 1 1
GO:1901564 organonitrogen compound metabolic process 1 1 1.07e-05 1 1 1 0.00681 0.0416 1 0.00032 1 1 0.0225 1 1
GO:1990748 cellular detoxification 1 1 1 0.0441 1 1 1 0.0417 1 1 0.0457 1 1 1 1
GO:0048037 cofactor binding 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0.048 1 1 1
GO:0055114 oxidation-reduction process 1 1 0.0262 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
……
注:行代表GO Term,列代表具体的样品或分组比较。数值表示富集分析中,对应GO进行Fisher精确检验的p值。如果在某个比较中,输出的GO_enrich文件中,定位不到对应的GO Term,则检验p值用1表示。
在分析模块“Batch Mode: GO Enrichment Analysis”中,默认输出p小于0.05的结果,建议设为1。然后,利用本分析模块进行统计。
后续,可以利用分析模块“Make Distance HeatMap”对结果进行可视化展示。
示例: