ATAC-seq结题报告

ATAC-SEQ数据标准分析结题报告

一、背景介绍

二、实验测序流程

1、实验步骤

2、上机测序

三、生物信息分析流程

四、结果展示及说明

1、原始序列数据

2、测序数据质量评估

2.1测序错误率分布检查

2.2碱基含量分布检查

2.3ADAPTERCONTENT分析

2.4测序数据过滤

3ATAC-SEQ数据分析结果展示

3.1项目小结

3.2主要结果展示

3.3ATAC-SEQ数据标准分析结果详解

3.3.1ATAC-SEQ数据参考序列比对(READSMAPPING)结果统计

3.3.2结合位点检测(PEAKCALLING)质量控制

3.3.3PEAKS在全基因组功能性区域上的分布注释

3.3.4回帖序列(MAPPEDREADS)在基因附近的分布特征分析

3.3.5ATAC-SEQ READS在基因上的分布HEATMAP

3.3.6结合位点(PEAK)进化保守性分析

3.3.7MOTIF分析

3.3.8结合位点关联基因筛选

3.3.9结合位点靶基因GO功能富集分析

3.3.10结合位点靶基因KEGGPATHWAY富集分析

3.4不同组ATAC-SEQ数据差异分析结果

3.4.1差异结合位点识别

3.4.2差异结合位点的MOTIF分析

3.4.3差异结合位点的靶基因分析

3.4.4差异位点靶基因的GO功能富集分析

3.4.5差异位点靶基因的KEGG富集分析

3.5ATAC-SEQRNA-SEQ数据联合分析结果

3.5.1ATAC-SEQ靶基因与RNA-SEQ差异基因分析

3.5.2OVERLAP基因GOKEGG富集分析

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