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ATAC-seq结题报告
ATAC-SEQ
数据标准分析结题报告
一、背景介绍
二、实验测序流程
1
、实验步骤
2
、上机测序
三、生物信息分析流程
四、结果展示及说明
1
、原始序列数据
2
、测序数据质量评估
2.1
测序错误率分布检查
2.2
碱基含量分布检查
2.3ADAPTERCONTENT
分析
2.4
测序数据过滤
3
、
ATAC-SEQ
数据分析结果展示
3.1
项目小结
3.2
主要结果展示
3.3ATAC-SEQ
数据标准分析结果详解
3.3.1ATAC-SEQ
数据参考序列比对(
READSMAPPING
)结果统计
3.3.2
结合位点检测(
PEAKCALLING
)质量控制
3.3.3PEAKS
在全基因组功能性区域上的分布注释
3.3.4
回帖序列(
MAPPEDREADS
)在基因附近的分布特征分析
3.3.5ATAC-SEQ READS
在基因上的分布
HEATMAP
3.3.6
结合位点(
PEAK
)进化保守性分析
3.3.7MOTIF
分析
3.3.8
结合位点关联基因筛选
3.3.9
结合位点靶基因
GO
功能富集分析
3.3.10
结合位点靶基因
KEGGPATHWAY
富集分析
3.4
不同组
ATAC-SEQ
数据差异分析结果
3.4.1
差异结合位点识别
3.4.2
差异结合位点的
MOTIF
分析
3.4.3
差异结合位点的靶基因分析
3.4.4
差异位点靶基因的
GO
功能富集分析
3.4.5
差异位点靶基因的
KEGG
富集分析
3.5ATAC-SEQ
与
RNA-SEQ
数据联合分析结果
3.5.1ATAC-SEQ
靶基因与
RNA-SEQ
差异基因分析
3.5.2OVERLAP
基因
GO
、
KEGG
富集分析
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