研究转录因子，这个数据库很好用！

如果你研究非编码RNA，那你需要先了解miRNA；而如果你要研究编码基因或者信号通路，那就多了解一下转录因子。

下面就来介绍一个研究转录因子的常用数据库——AnimalTFDB：

http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB/#!/

我们看到的数据库是更新过的3.0版本的：

AnimalTFDB 3.0: a comprehensive resource for annotation and prediction of animal transcription factors.Nucleic Acids Res. 2018 Sep 11. doi: 10.1093/nar/gky822.，是华中科技大学郭安源教授团队建立并维护的

AnimalTFDB 3.0数据库收录的信息很多很全：

涵盖了97个物种、12万的转录因子、8万的转录辅因子（Cofactor）以及这些转录（辅）因子的家族、表达、通路、表型、蛋白互作等等信息。

可以通过浏览家族和物种查看：

也可以直接看每个转录因子的基本信息，如功能结构域、互作网络及表达：

下面我们再看一个功能：根据某段基因序列预测结合的转录因子

在Predict TFBS下面，我们直接输入FASTA格式的序列，然后单击提交就可以了：

在右侧我们就可以看到转录因子的名字和符合的序列。

当然，如果你想反向操作（通过转录因子预测靶基因：如何根据转录因子预测靶基因？），可以用这个数据库——hTFtarget database：

http://bioinfo.life.hust.edu.cn/hTFtarget#!/

在TF选项中输入转录因子的名字，如NFE2：

再单击红框的details就可以了：

其实hTFtarget database这个数据库也很好用，大家可以从中找到一些新的课题思路：

比如这个联系转录因子、lncRNA和SNP的条目。

具体如何使用就看大家自己去探索了。