ChIP-seq结题报告模板

目录

1、项目信息

　 1.1基本思想

　 1.2实验流程

　 1.3信息流程分析

　 1.4样品说明

2、数据过滤与比对

　 2.1原始数据

　 2.2数据过滤

　 2.3数据质量值分布

　 2.4数据碱基分布

　 2.5比对分析

　 2.6比对质量

　 2.7相关性分析

　 2.8Reads 分布

      2.8.1覆盖度

　    2.8.2在染色体分布

　    2.8.3在Repeats区域分布

　    2.8.4在功能原件分布

3、Peaks识别

     3.1Frag_size预测

　   3.2覆盖度

　   3.3长度分布

　   3.4在染色体分布

　   3.5在功能原件分布

　   3.6显著程度分布

　   3.7富集倍数分布

　   3.8封顶个数

4、Reads分布

     4.1TSS上下游

　   4.2TES上下游

      4.3封顶上下游Reads分布

5、差异分析

     5.1 P ea k s区域R ea d s富集分析

     5.2 P ea k s富集倍数分析

     5.3 P ea k s差异分析

     5.4 差异相关基因分析

6 、富集分析

      6 .1 G O 富集分析

          6.1.1 GO 统计

          6.1.2 GO 富集DAG图

          6.1.3 显著功能富集分析

       6 .2 K E G G 富集分析

          6.2.1 KEGG通路分析

          6.2.2 显著功能富集分析

          6.2.3 富集通路图

7 、参考文献

8 、帮助说明

      8 .1 IG V 使用说明