Agilent aCGH芯片

　　基于基因芯片的比较基因组杂交技术（array-based Comparative Genomic Hybridization, aCGH）可以更加准确地发现疾病相关的染色体的变异，为疾病的诊断和治疗提供极大的帮助，这对高风险人群的健康水平筛查，疾病预防有重要意义。Agilent利用其先进的芯片生产工艺，开发出高性能的aCGH芯片，广泛用于基因的拷贝数检测和染色体结构变化检测。为寻找新的原癌基因或抑癌基因，揭示生物体抗药性的机制及代谢过程中可能发生的基因组变化，发现新的生物标记等提供新的技术。


技术特点：

1.探针覆盖全基因组，包括基因区域（内含子区/外显子区）、基因间区域以及对疾病研究极其重要的亚端粒区域（重复序列除外）；

2.高灵敏度和高特异性地检测拷贝数变异CNV、杂合性缺失和单亲二倍体(LOH/UPD)；


3.最佳的信噪比和结果重现性；



4.可通过在线系统SureDesign灵活定制芯片，多种规格可选；



5.芯片产品广泛地应用于遗传病、肿瘤、精神障碍、糖尿病等风险筛查和产前筛查等临床研究领域。


产品列表：


人CGH芯片：

芯片名称
规格
探针数目
数据库
分辨率
Human CGH Microarray
1 x 1M
963,029
UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 2006
2.1 KB overall median probe spacing (1.8 KB in Refseq genes)


2x 400K
411,056


5.3 KB overall median probe spacing (4.6 KB in Refseq genes)


4x 180K
170,334


13 KB overall median probe spacing (11 KB in Refseq genes)


8 x 60K
55,077


41 KB overall median probe spacing (33 KB in Refseq genes)
Human CGH+SNP Microarray
2x400K
292,097(CGH)+119,091 (SNP)
UCSC hg19 (NCBI Build 37, February 2009)
7.2kb overall median probe spacing (4.5 KB in Refseq genes)



小鼠CGH芯片：

Mouse Genome CGH Microarrays
1x1M
963,261
UCSC mm9 (NCBI Build37), July 2007
1.8 KB overall median probe spacing (1.5 KB in Refseq genes)


4x180K
170,305


10.9 KB overall median probe spacing (9.1 KB in Refseq genes)


1x244K
235,402
UCSC mm8 (NCBI Build36), February 2006
7.8 KB overall median probe spacing (6.2 KB in Refseq genes)


2x105K
98,797


19.3 KB overall median probe spacing (15.7 KB in Refseq genes)




大鼠CGH芯片：

Rat Genome CGH Microarrays
1x1M
962,967
UCSC rn4 (Baylor HGSC Build 3.4) November 2004
1.7 KB overall median probe spacing (1.3 KB in Refseq genes)


4x180K
170,012


10.7 KB overall median probe spacing (8.0 KB in Refseq genes)


1x244K
235,974


4.9 KB overall median probe spacing (4.7 KB in Refseq genes)


2x105K
97,973


19.1 KB overall median probe spacing (11.3 KB in Refseq genes)



其他模式物种：

牛Bovine
4x180k
171,527
UCSC bosTau4 (October2007)
11.0 KB overall median probe spacing
羊Canine
4x180k
171,534
UCSC canFam2 (May2006)
2.7 kb overall median probe spatial resolution
鸡Chicken
1x244K
235,980
UCSC galGal3 (WUSTLBuild 2.1, May 2006)
4 kb overall median probe spacing
黑猩猩
Chimpanzee
4x180k
171,524
UCSC panTro2 (March2006)
12.7 kb overall median probe spatial resolution
水稻Rice
4x180k
171,861
RGSP Build5 (June2008)
14.9 kb overall median probe spatial resolution
恒河猴
Rhesus Macaque
4x180k
171,495
UCSC rheMac2 (January 2006)
14.9 kb overall median probe spatial resolution
其他物种
定制规格可选：1x1M，2x400K ，4x180K，8x60K





实验流程：



数据展示：

人类21号染色体三体性（唐氏综合症）检测


人类17号染色体杂合子缺失检测


人

类11号染色体双亲血缘连续纯合性检测


人


类15号染色体单亲二倍体（UPD）检测


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