采用NULISA验证常染色体显性阿尔茨海默病的早期变化

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2024年10月31日,来自华盛顿大学的Carlos Cruchaga教授团队在Cell杂志发表题为《CSF proteomics identifies early changes in autosomal dominant Alzheimer’s disease》的研究文章。

一、核心样本与设计:无法复制的“预测性”队列

研究的突破性首先建立在独一无二的样本资源上:

  • 样本类型脑脊液。这是反映大脑细胞外液生化状态最直接的窗口,是发现中枢神经系统特异性早期变化的“金标准”样本。

  • 队列来源常染色体显性遗传阿尔茨海默病(ADAD) 家族成员。这些个体因携带APP、PSEN1/2等致病基因突变,几乎必然发病,且发病年龄可基于家族史进行相对准确的预估。

  • 设计优势:研究者根据参与者的“预估发病年限”将其排序,从而在一个横断面研究中,实现了对疾病“倒计时”过程的准纵向观测。这使得在症状出现前10-25年追踪生物学事件成为可能,这是散发性AD研究无法做到的。

二、技术路线:发现式蛋白质组学绘制动态图谱

  1. 核心技术:使用高通量蛋白质组学(很可能基于质谱技术)对CSF样本进行深度分析。该方法无需预先假设,可一次性对数千种蛋白质进行鉴定和定量。

  2. 分析策略

    • 时间关联分析:将蛋白质表达水平与“预估发病年限”关联,识别在特定疾病阶段(如病理出现前、病理出现后)发生变化的蛋白。

    • 生物信息学挖掘:对差异蛋白进行通路和网络分析,构建病理生理过程的动态演变模型。

据悉,该研究采用来自Alamar的NULISA 120-plex中枢神经系统Panel对染色体显性阿尔茨海默病蛋白标志物组合进行了验证。研究发现,使用NULISA技术,即使仅用三种蛋白质(SMOC1, GFAP, and NPTX2),它们对于突变状态(AUC = 0.781)和临床状态(AUC = 0.876)都显示出了很高的预测能力。

参考文献及信息来源
[1]. CSF proteomics identifies early changes in autosomal dominant Alzheimer’s disease
Shen, YuanyuanNoble, James M. et al. Cell, Volume 187, Issue 22, 6309 - 6326.e15


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