Filter LEFSe result(过滤LEfSe结果)
分析模块根据LEfSe分析结果中第一列进行关键字过滤。如果第一列字符串与设置的关键字匹配,则该行会被过滤。
输入:
LEfSe分析结果文件,由分析模块 "LDA Effect Size (LEfSe) Analysis" 生成。
示例:
Bacteria.Proteobacteria.Deltaproteobacteria.Other.Other 0.0 -
Bacteria.Proteobacteria.Gammaproteobacteria.Alteromonadales.Alteromonadaceae.Microbulbifer 0.0 -
Bacteria.Firmicutes.Bacilli.Lactobacillales.Streptococcaceae 0.0 0.0209213353378
Bacteria.Proteobacteria.Alphaproteobacteria.Rhodospirillales.Acetobacteraceae.Asaia 0.0 -
设置过滤关键字为:
输出:
过滤后的LEfSe分析结果:
Bacteria.Proteobacteria.Gammaproteobacteria.Alteromonadales.Alteromonadaceae.Microbulbifer 0.0 -
Bacteria.Firmicutes.Bacilli.Lactobacillales.Streptococcaceae 0.0 0.0209213353378
Bacteria.Proteobacteria.Alphaproteobacteria.Rhodospirillales.Acetobacteraceae.Asaia 0.0